En un correo enviado a sus desarrolladores, Apple advirtió que todas las aplicaciones para iPhone tienen que ser compatibles con nuevo el sistema operativo 3.0 del teléfono como también la versión 2.2.1 para ser recibidas en el App Store. Este comunicado se da al poco tiempo de estrenarse el cinco beta para el nuevo firmware que fue revelado en mazo durante una rueda de prensa.

Apple también dio a conocer que cualquier aplicaciones que este actualmente en su tienda pero no funcionen adecuadamente en la versión 3.0 del iPhone será eliminada una vez que la versión final del firmware sea distribuida a sus usuarios. En respuesta a esto muchos desarrolladores han expresado su preocupaciones ya que no solo se ven forzados a modificar su código actual sino que aun no tiene una fecha para el lanzamiento del nuevo sistema operativo (se especula que será en junio durante el evento WWDC de Apple) y las pruebas las tiene que hacer con un sistema operativo que aun no ha sido terminado.

En contraste a las preocupaciones, en el mismo correo Apple dice que la mayoría de aplicaciones debería correr sin modificaciones en el nuevo sistema operativo. Sin embargo, algunos desarrolladores no están de acuerdo con esta declaración.